Por primera vez en México, investigadores del CIR-Uady lograron identificar y obtener la secuencia completa del genoma del virus chikungunya, del linaje Este-Centro-Sur Africano (ECSA).
Este linaje es diferente al asiático que circuló durante el brote de chikungunya que se registró en México en 2015, por lo que detectar su introducción es relevante para fortalecer la vigilancia epidemiológica y la capacidad de respuesta ante posibles brotes.
El logro científico fue posible en Yucatán, en el Laboratorio de Virología del Centro de Investigaciones Regionales (CIR) Dr. Hideyo Noguchi, donde ya realizan análisis genómicos de alta especialidad que permiten identificar con precisión los virus que circulan entre la población.
Secuencian un nuevo linaje de chikungunya con muestra clínica de un viajero
Investigadores de la Universidad Autónoma de Yucatán (Uady) obtuvieron la secuenciación genómica a partir de una muestra clínica de un viajero que presentó un síndrome febril al ingresar a México.
Mediante tecnología portátil MinION de Oxford Nanopore y herramientas bioinformáticas para el análisis filogenético, el equipo pudo confirmar la presencia del linaje ECSA y obtener su primer genoma completo registrado en el país.
¿Por qué es importante tener un mapa genético?
De acuerdo con datos de la Organización Panamericana de la Salud (OPS), entre 2025 y 2026, en la región se han registrado cerca de 500 mil casos sintomáticos asociados con este linaje, según datos del estudio.
Mientras tanto, en México la Secretaría de Salud ha confirmado 31 casos de chikungunya.
Por eso es importante conocer el mapa genético completo de los linajes que están siendo introducidos a la región, para fortalecer la vigilancia y generar información clave que permita anticiparse a posibles brotes.
“Ese virus que está afectando a la población de América, particularmente en Cuba, de alguna manera está ya circulando en nuestra población, y este hallazgo nos permite reaccionar ante un eventual brote”, explicó a la Uady Henry Puerta-Guardo, investigador asociado del Laboratorio de Virología.
El investigador que lidera el equipo EPICVAC-ARBO explicó que, al igual que ocurre con las variantes de otros virus, la secuenciación permite conocer su “huella genética” e identificar a qué linaje pertenece.
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Tecnología, infraestructura y personal especializado permite atender brotes
Puerta-Guardo explicó que este tipo de análisis tradicionalmente se centraliza y las muestras deben enviarse al centro del país.
Ahora, gracias a la tecnología, infraestructura y personal especializado con que cuenta el CIR, el equipo pudo aislar, secuenciar e identificar el virus durante un fin de semana.
“Prácticamente aquí en casa ya podemos responder ante un eventual brote”, afirmó.
Esta capacidad permite generar información que puede compartirse con las autoridades sanitarias para fortalecer estrategias de vigilancia epidemiológica, diagnóstico, control vectorial y prevención.
El objetivo es avanzar de una respuesta reactiva hacia una actuación cada vez más oportuna.
¿Qué es el chikungunya y cuáles son los síntomas?
El chikungunya es transmitido principalmente por los mosquitos Aedes aegypti y Aedes albopictus.
Entre sus síntomas se encuentran fiebre alta, dolor intenso en las articulaciones, dolor muscular y cefalea.
En algunos pacientes, las molestias articulares pueden persistir durante meses o incluso años.
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¿Cómo prevenir la enfermedad?
Puerta-Guardo recordó que la prevención continúa siendo fundamental, por eso llamó a eliminar recipientes y espacios donde puedan reproducirse los mosquitos.
También recomendó mantener un adecuado manejo de residuos y recurrir a las autoridades cuando se detecten criaderos que no puedan ser controlados por la propia población.
Yucatán, un referente en vigilancia genómica
Este avance histórico fortalece la vigilancia genómica y posiciona al Centro como referente en este tipo de análisis en la Península de Yucatán y el sureste del país.
“Estamos a la vanguardia de lo que se está haciendo en el mundo. Con esto estamos diciéndoles a los investigadores de la región: podemos hacerlo, podemos responder y estamos preparados para responder”, destacó Puerta-Guardo.
El trabajo mantiene colaboración con instancias de salud pública y contempla también la transferencia de conocimientos y capacitación de personal para ampliar estas capacidades.
También se contó con la colaboración de instituciones nacionales como la UNAM e internacionales integrados en un equipo multidisciplinario de investigadores, estudiantes Y especialistas en áreas como biología, química y ciencias de la salud.
El proyecto para identificar y secuenciar el genoma completo de un linaje de chikungunya distinto al que circuló durante el brote de 2015, contempla además la transferencia de conocimientos y la capacitación de personal, con el propósito de ampliar las capacidades para el estudio de arbovirus y otras enfermedades infecciosas emergentes.